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グアダラハラ連邦農務省(グアダラハラれんぽうのうむしょう)はグアダラハラ連邦の行政機関の一つである。グアダラハラ連邦の農務を司る省庁である。

グアダラハラ連邦では建国より農業は工業よりも比較的重視されており、この産業を司るため1926年に現在のグアダラハラ連邦農務省の前身となるグアダラハラ連邦農業庁が発足した。農業庁は連邦政府科学技術部(当時の名称、現在は科学技術局に変更)と協力し新たな改良種及び新種の開発及び研究を行った、これによりグアダラハラ連邦の農業は大きく発展していった。これらの開発及び研究の業務以外にも動植物の検疫、植物の保護、農業関連の経済調査、自然資源の保護が業務となっている。これらの業務拡大に従い1983年にグアダラハラ連邦農務省として改編された。以前の農業庁は国務省の管轄下であったため国務省の指定した人物が代表を務めていた。しかし連邦農務省への改編により、大統領指定の人物が「農務長官」として務める事となった。

連邦生産計画部
連邦年間マーケティング統計調査部

連邦統合資料管理部
連邦乳製品資料部
連邦青果資料部
連邦家畜資料部
連邦農作物資料部
連邦農務関連他資料管理部

連邦農作物検疫部
連邦家畜検疫部
連邦乳製品検疫部
連邦青果検疫部
連邦農務食品関連検査部

連邦農作物発展部
連邦青果発展部
連邦乳製品発展部
連邦家畜発展部
連邦農業環境発展部
連邦農業者支援部
統合農業発展研究部